傳統(tǒng)理論認(rèn)為，水體污染后種植水生植物是一種生態(tài)無污染的水處理方法，該方法就是模擬生態(tài)系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)，對食物鏈中的生物進(jìn)行合理配置，從而使食物鏈中各個生物之間能相輔相成。遺憾的是這種方法掌握起來較難，管理技術(shù)要求頗高，調(diào)控過程非常復(fù)雜，抗自然災(zāi)害風(fēng)險能力很弱。

種植水生植物的水環(huán)境是一種比較復(fù)雜的生態(tài)系統(tǒng)，而水體本身就是一個微生物生態(tài)系統(tǒng)。這種微生態(tài)系統(tǒng)更原始，更穩(wěn)定，更易維持。湖泊，河流，海洋等各種地面水中都存在著各種各樣的微生物，但它們所含的微生物種類、數(shù)量和分布都不相同。其中有些是“土生土長”的，例如自養(yǎng)菌中的硫磺細(xì)菌，硝化細(xì)菌，鐵細(xì)菌，光合細(xì)菌等。異養(yǎng)菌中的假單胞桿菌，放線菌，真菌，原生動物及藻類。另一些水生細(xì)菌是外來的，它們來自土壤，空氣，垃圾，工廠廢物或城市下水道污水。在這些微生物中，其中對水體感官比較好的是好氧菌，其可以利用水體中的污染物為營養(yǎng)物質(zhì)進(jìn)行生長繁殖，而且它們的代謝產(chǎn)物同人類相同，都是二氧化碳和水。

微生態(tài)學(xué)原理也被完美應(yīng)用于景觀水處理行業(yè)中。北京佳業(yè)佳境環(huán)保科技有限公司的HDP景觀水直接凈化技術(shù)工藝首次直接在景觀水體內(nèi)部建立一個“看不見的污水處理廠”，培養(yǎng)龐大的微生物種群，建立健康的微生態(tài)體系，使微生物通過新陳代謝完成對污染物的去除，達(dá)到水質(zhì)凈化的目的，是一種更為經(jīng)濟(jì)有效的生態(tài)方法。